Cell | 免疫疾病中的免疫细胞特异基因调控动态全景图

日本大学的分析技术人员和RIKEN Research分析所的同事们仍然建立了首个针对自身特异性疟疾和自身泌尿系统疟疾的基因基因序列信息库。希望这一教育资源能为自体疟疾的发展提供取而代之观念，并似乎有助于制剂的发掘出。生物学家们还希望，与自体特别的基因基因序列组信息概要最终似乎应用于诸如COVID-19等传染病的分析。

日本大学重大项目分析助理，药理学风湿病学家，系统基因基因序列组学专家Mineto Ota博士话说：“要了解到疟疾，就需深刻理解基因基因序列人体内的系统。有了这个信息集，我们就可以将与疟疾特别的DNA基因序列变动的信息与对疟疾发病机制极其最主要的基因基因序列和巨噬细胞型式保持联系大大的。”Ota是该制作团队发表在《Cell》杂志上的篇文章的主要创作者，篇文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该重大项目是与Chugai Pharmaceutical的生物学家们合作关系同步进行的。

创作者写到，自体介导的疟疾（IMD）还包括从自身特异性到自身发炎的多种病理。他们援引，尽管IMD里炎性巨噬细胞因子的反常活动表明淋巴巨噬细胞系统引发了变动，但是，“对于IMD的特别基因基因序列甚至特别巨噬细胞型式知之甚少。”

同类型基因基因序列组共同点分析（GWAS）发掘出了许多与IMD特别的基因基因序列组残基。但是，在此类共同点分析里鉴定出的许多基因基因序列人体内都设于调节基因基因序列“on”或“off”解读的DNA非UTF-周边，而不是设于基因基因序列UTF-基因序列里。分析该小组援引：“GWAS仍然探究了许多与多样遗传和疟疾特别的基因基因序列组残基，还包括IMD。这些人体内里的大多数都设于非UTF-基因基因序列组周边，尤其是抑制模组，如增强子和核糖体。”

为了探究抑制DNA的系统，一种相异型式的基因基因序列组分析，称为解读表征遗传基因基因序列残基（eQTL），旨在将DNA基因序列的相异与调控的相异保持联系大大的。利用eQTL信息，分析技术人员可以对抑制DNA基因序列的目的、抑制基因序列里的人体内如何影响其抑制基因基因序列的解读以及这些调控相异如何随之而来疟疾做出不够明智的传闻。

其它针对自体的eQTL分析仍然在同步进行里，但在此之后的分析工作只还包括卫生民间组织，并检查了受限数目的巨噬细胞型式。分析技术人员写到：“对卫生供体淋巴巨噬细胞的分析似乎无法捕获疟疾静止状态下发掘出的一系列eQTL畸变。此外，虽然对淋巴巨噬细胞的实验性刺激可以在某种程度上模拟疟疾静止状态，但并不平常看出出巨噬细胞内的认知自然环境。”

Ota缺少道：“发炎静止状态下，淋巴巨噬细胞的电学功用与卫生静止状态下的不尽相同巨噬细胞截然相异。与自体状况特别的基因基因序列人体内似乎只在染病静止状态下起作用，因此对于这种型式的基因基因序列分析，从真正患者身上获取抽样极其最主要。”

在他们最新报道的分析里，分析该小组对79名卫生民间组织和337名被病症忧郁症10种相异型式自体介导疟疾（还包括类风湿性关节炎、系统化红斑狼疮和系统化硬化症）的患者同步进行了同类型基因基因序列组人类基因组计划。所有民间组织都是日本血缘关系。

了解到自体介导的疟疾带有挑战性，因为尽管每种疟疾在药理学上都是相异的，但仍有许多交叠之出口处，并且带有不尽相同病症的患者似乎会显出出极其相异的症状。分析技术人员缺少话说：“由于所有这些生态系统，一次学习一种自体介导疟疾的能力是受限的。但是，如果我们一起分析10种疟疾，就可以不够新一轮地了解到这些型式的疟疾。”

在完成同类型基因基因序列组人类基因组计划后，分析技术人员从民间组织的血液抽样里分离出28种相异型式的自体特别巨噬细胞，并测量了这些巨噬细胞里的调控。“我们在概要里看到，每种淋巴巨噬细胞型式都有相异的eQTL结果，这可以说道我们巨噬细胞型式密切关系基因基因序列抑制的相异，以及哪种巨噬细胞型式对于发展哪种疟疾至关最主要。”分析技术人员话说。

创作者分析报告话说，“在调控分析里，我们在一个该平台上对多个IMD同步进行较为，使我们能够描述每个疟疾（患者）的特征，并辨认与单个疟疾特异性特别的基因基因序列，以及在组合成IMD里失调的渠道……我们的信息集使我们能够测定每个特定巨噬细胞型式里eQTL畸变的认知（疟疾）背景马达的分心。”

分析技术人员将赢取的教育资源命名为日本大学淋巴巨噬细胞调控概要（ImmuNexUT），并话说它值得一提的是了使用东南亚血缘关系民间组织建立的最主要的eQTL信息集。他们总结道：“我们断定了淋巴巨噬细胞型式特异性的eQTL畸变，还包括实际上没报道的罕见巨噬细胞型式，它们在认知发炎条件下的生态系统，以及这些eQTL与IMD遗传密切关系的显着共同点。”

“到目前为止，在这一教育领域，大规模的基因基因序列组和系统基因基因序列组分析主要是利用国家人口为120人同步进行的，尽管族群生态系统对于精确理解基因基因序列组系统至关最主要。”分析技术人员话说，“这个日本患者的eQTL概要对于摆脱这种以国家为里心的种族主义，结合国家的信息集进一步分析DNA人体内的系统，也带有最主要意味。”

分析技术人员希望ImmuNexUT信息库将此后增长速度，并最终为患者带来不够好的结果。他们话说：“与之前报道的教育资源相比，我们的信息集带有独特而有利的特点，还包括新一轮的淋巴巨噬细胞拆分、人口为120人密切关系自体状况的变动以及同质的非国家人口为120人。”