Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控自适应全景图

筑波大学的深入研究医护人员和RIKEN Research深入研究小组的熟人们并未建立了首个针对自身自身免疫系统病因和自身黏膜性病因的蛋白质统计数据库。希望这一天然资源能为免疫系统病因的其发展提供新的论点，并似乎有助于药品的发现。研究小组们还希望，与免疫系统系统性的蛋白质组统计数据记事就此似乎应用于诸如COVID-19等黄热病的深入研究。

筑波大学项目深入研究助理，临床风湿病学家，必要蛋白质组学专家Mineto Ota博士说道：“要明白病因，就必须深刻理解蛋白质反转的必要。有了这个统计数据集，我们就可以将与病因系统性的DNA基因组变化的统计数据与对病因发病必要极为极其重要的蛋白质和巨噬细胞子类连系出去。”Ota是该他的团队发表在《Cell》杂志上的文章的主要作者，文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究小组们共同开展的。

作者说道，免疫系统介导的病因（IMD）包含从自身自身免疫系统到自身黏膜的多种病理。他们指出，尽管IMD里炎性巨噬细胞因子的异常大型活动表明诱导必要发生了变化，但是，“对于IMD的系统性蛋白质甚至系统性巨噬细胞子类知之甚少。”

均蛋白质组关连性深入研究（GWAS）发现了许多与IMD系统性的蛋白质组位点。但是，在此类关连性深入研究里核对出的许多蛋白质反转都坐落于适度蛋白质“on”或“off”理解的DNA非编码地带，而不是坐落于蛋白质编码基因组里。深入研究小组指出：“GWAS并未了解到了许多与复杂变异和病因系统性的蛋白质组位点，包含IMD。这些反转里的大多数都坐落于非编码蛋白质组地带，特别是在是依赖性元件，如增强子和启动子。”

为了了解到依赖性DNA的必要，一种各有不同子类的蛋白质组分析方法，称为理解定量变异蛋白质位点（eQTL），旨在将DNA基因组的差异与蛋白质理解的差异连系出去。借助于eQTL统计数据，深入研究医护人员可以对依赖性DNA基因组的用意、依赖性基因组里的反转如何影响其依赖性蛋白质的理解以及这些蛋白质理解差异如何导致病因做出不够明智的臆测。

其它针对免疫系统的eQTL深入研究并未在开展里，但在此之后的深入研究工作只包含保健医务医护人员，并检查了受限制数量的巨噬细胞子类。深入研究医护人员说道：“对保健供体诱导的深入研究似乎不能捕获病因状况下发现的一系列eQTL现像。此外，虽然对诱导的实验性刺激可以在某种程度上模拟病因状况，但并不总是反映出人体内的生物体环境。”

Ota必要道：“黏膜状况下，诱导的物理物理性质与保健状况下的大致相同巨噬细胞截然各有不同。与免疫系统状况系统性的蛋白质反转似乎只在患病状况下起起着，因此对于这种子类的蛋白质深入研究，从真实病征身上受益样本极为极其重要。”

在他们最新报道的深入研究里，深入研究小组对79名保健医务医护人员和337名被诊断患10种各有不同子类免疫系统介导病因（包含类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和系统性硬化症）的病征开展了均蛋白质组测序。所有医务医护人员都是日本血统。

明白免疫系统介导的病因具备说服力，因为尽管每种病因在临床上都是各有不同的，但仍有许多交叠之三处，并且具备大致相同诊断的病征似乎会表现出极为各有不同的病征。深入研究医护人员必要说道：“由于所有这些多样性，一次学习一种免疫系统介导病因的能力是受限制的。但是，如果我们一同深入研究10种病因，就可以不够均面地明白这些子类的病因。”

在完成均蛋白质组测序后，深入研究医护人员从医务医护人员的血液样本里分离出28种各有不同子类的免疫系统系统性巨噬细胞，并测定了这些巨噬细胞里的蛋白质理解。“我们在记事里看着，每种诱导子类都有各有不同的eQTL结果，这可以告诉我们巨噬细胞子类间蛋白质依赖性的差异，以及哪种巨噬细胞子类对于其发展哪种病因至关极其重要。”深入研究医护人员说道。

作者报告说道，“在蛋白质理解分析方法里，我们在一个模拟器上对多个IMD开展比较，使我们能够阐述每个病因（病征）的特征，并标识与单个病因专一性系统性的蛋白质，以及在一组IMD里失调的通路……我们的统计数据集使我们能够侦测每个特定巨噬细胞子类里eQTL现像的生物体（病因）时代背景驱动的电磁干扰。”

深入研究医护人员将得到的天然资源命名为筑波大学诱导蛋白质理解记事（ImmuNexUT），并说道它代表了使用东亚地区血统医务医护人员建立的最大的eQTL统计数据集。他们总结道：“我们确定了诱导子类专一性的eQTL现像，包含以前未报道的相像巨噬细胞子类，它们在生物体黏膜条件下的多样性，以及这些eQTL与IMD蛋白质型间的突出关连性。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的蛋白质组和必要蛋白质组深入研究主要是借助于欧洲**开展的，尽管人群多样性对于直观理解蛋白质组必要至关极其重要。”深入研究医护人员说道，“这个日本受试者的eQTL记事对于克服这种以欧洲为里心的愚昧，混合欧洲的统计数据集大幅度深入研究DNA反转的必要，也具备极其重要意义。”

深入研究医护人员希望ImmuNexUT统计数据库将继续增长，并就此为病征随之而来不够好的结果。他们说道：“与之前报道的天然资源相比，我们的统计数据集具备截然不同而有利的优点，包含均面的诱导分作、**间免疫系统状况的变化以及所谓的非欧洲**。”